Protein–RNA interactions for Protein: P43115

PTGER3, Prostaglandin E2 receptor EP3 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER3P43115 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTGER3P43115 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTGER3P43115 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PTGER3P43115 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTGER3P43115 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTGER3P43115 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTGER3P43115 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTGER3P43115 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PTGER3P43115 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTGER3P43115 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTGER3P43115 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTGER3P43115 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTGER3P43115 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTGER3P43115 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTGER3P43115 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTGER3P43115 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTGER3P43115 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTGER3P43115 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTGER3P43115 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTGER3P43115 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTGER3P43115 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PTGER3P43115 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTGER3P43115 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTGER3P43115 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTGER3P43115 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTGER3P43115 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PTGER3P43115 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PTGER3P43115 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PTGER3P43115 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PTGER3P43115 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PTGER3P43115 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PTGER3P43115 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PTGER3P43115 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PTGER3P43115 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PTGER3P43115 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
PTGER3P43115 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTGER3P43115 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PTGER3P43115 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTGER3P43115 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTGER3P43115 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTGER3P43115 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PTGER3P43115 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTGER3P43115 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTGER3P43115 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTGER3P43115 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTGER3P43115 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PTGER3P43115 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTGER3P43115 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
PTGER3P43115 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PTGER3P43115 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PTGER3P43115 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PTGER3P43115 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PTGER3P43115 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PTGER3P43115 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PTGER3P43115 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PTGER3P43115 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PTGER3P43115 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PTGER3P43115 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
PTGER3P43115 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PTGER3P43115 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PTGER3P43115 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PTGER3P43115 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PTGER3P43115 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PTGER3P43115 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PTGER3P43115 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTGER3P43115 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTGER3P43115 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PTGER3P43115 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PTGER3P43115 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTGER3P43115 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTGER3P43115 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTGER3P43115 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTGER3P43115 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PTGER3P43115 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTGER3P43115 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PTGER3P43115 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTGER3P43115 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTGER3P43115 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PTGER3P43115 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PTGER3P43115 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTGER3P43115 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTGER3P43115 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PTGER3P43115 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PTGER3P43115 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTGER3P43115 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTGER3P43115 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTGER3P43115 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTGER3P43115 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTGER3P43115 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTGER3P43115 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTGER3P43115 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTGER3P43115 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTGER3P43115 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTGER3P43115 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTGER3P43115 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PTGER3P43115 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTGER3P43115 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTGER3P43115 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PTGER3P43115 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTGER3P43115 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms