Protein–RNA interactions for Protein: P42262

GRIA2, Glutamate receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA2P42262 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIA2P42262 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIA2P42262 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIA2P42262 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIA2P42262 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIA2P42262 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIA2P42262 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIA2P42262 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIA2P42262 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIA2P42262 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIA2P42262 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIA2P42262 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIA2P42262 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIA2P42262 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIA2P42262 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GRIA2P42262 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GRIA2P42262 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GRIA2P42262 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GRIA2P42262 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GRIA2P42262 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GRIA2P42262 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GRIA2P42262 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GRIA2P42262 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GRIA2P42262 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GRIA2P42262 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
GRIA2P42262 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GRIA2P42262 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GRIA2P42262 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
GRIA2P42262 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GRIA2P42262 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GRIA2P42262 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GRIA2P42262 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GRIA2P42262 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GRIA2P42262 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GRIA2P42262 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GRIA2P42262 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GRIA2P42262 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GRIA2P42262 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GRIA2P42262 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GRIA2P42262 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GRIA2P42262 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GRIA2P42262 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GRIA2P42262 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GRIA2P42262 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GRIA2P42262 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GRIA2P42262 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GRIA2P42262 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GRIA2P42262 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GRIA2P42262 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GRIA2P42262 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GRIA2P42262 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GRIA2P42262 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GRIA2P42262 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GRIA2P42262 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GRIA2P42262 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GRIA2P42262 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GRIA2P42262 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GRIA2P42262 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GRIA2P42262 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GRIA2P42262 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GRIA2P42262 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GRIA2P42262 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GRIA2P42262 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GRIA2P42262 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GRIA2P42262 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GRIA2P42262 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GRIA2P42262 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GRIA2P42262 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GRIA2P42262 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GRIA2P42262 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GRIA2P42262 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GRIA2P42262 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GRIA2P42262 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GRIA2P42262 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GRIA2P42262 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GRIA2P42262 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GRIA2P42262 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GRIA2P42262 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GRIA2P42262 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GRIA2P42262 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GRIA2P42262 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GRIA2P42262 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GRIA2P42262 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GRIA2P42262 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GRIA2P42262 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GRIA2P42262 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GRIA2P42262 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GRIA2P42262 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GRIA2P42262 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GRIA2P42262 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GRIA2P42262 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GRIA2P42262 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GRIA2P42262 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GRIA2P42262 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GRIA2P42262 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GRIA2P42262 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GRIA2P42262 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GRIA2P42262 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GRIA2P42262 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GRIA2P42262 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms