Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GJC1P36383 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GJC1P36383 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GJC1P36383 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GJC1P36383 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GJC1P36383 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GJC1P36383 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GJC1P36383 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GJC1P36383 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
GJC1P36383 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GJC1P36383 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GJC1P36383 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GJC1P36383 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GJC1P36383 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GJC1P36383 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GJC1P36383 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GJC1P36383 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GJC1P36383 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GJC1P36383 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GJC1P36383 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GJC1P36383 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GJC1P36383 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GJC1P36383 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJC1P36383 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJC1P36383 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJC1P36383 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJC1P36383 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJC1P36383 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJC1P36383 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJC1P36383 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJC1P36383 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJC1P36383 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJC1P36383 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJC1P36383 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJC1P36383 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJC1P36383 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJC1P36383 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJC1P36383 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJC1P36383 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJC1P36383 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJC1P36383 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJC1P36383 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GJC1P36383 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJC1P36383 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GJC1P36383 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJC1P36383 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJC1P36383 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJC1P36383 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJC1P36383 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJC1P36383 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJC1P36383 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GJC1P36383 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJC1P36383 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJC1P36383 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJC1P36383 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJC1P36383 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJC1P36383 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJC1P36383 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJC1P36383 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJC1P36383 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJC1P36383 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJC1P36383 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJC1P36383 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJC1P36383 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJC1P36383 PSME4-202ENST00000404125 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJC1P36383 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GJC1P36383 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJC1P36383 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJC1P36383 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJC1P36383 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJC1P36383 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJC1P36383 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJC1P36383 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GJC1P36383 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GJC1P36383 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GJC1P36383 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GJC1P36383 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GJC1P36383 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GJC1P36383 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GJC1P36383 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GJC1P36383 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GJC1P36383 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GJC1P36383 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GJC1P36383 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GJC1P36383 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GJC1P36383 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GJC1P36383 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GJC1P36383 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GJC1P36383 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GJC1P36383 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GJC1P36383 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GJC1P36383 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GJC1P36383 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GJC1P36383 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GJC1P36383 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GJC1P36383 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GJC1P36383 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GJC1P36383 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GJC1P36383 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GJC1P36383 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.9 ms