Protein–RNA interactions for Protein: P35244

RPA3, Replication protein A 14 kDa subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA3P35244 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPA3P35244 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPA3P35244 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPA3P35244 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPA3P35244 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPA3P35244 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPA3P35244 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPA3P35244 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPA3P35244 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPA3P35244 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPA3P35244 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RPA3P35244 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPA3P35244 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPA3P35244 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RPA3P35244 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPA3P35244 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPA3P35244 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPA3P35244 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RPA3P35244 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPA3P35244 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPA3P35244 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPA3P35244 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPA3P35244 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RPA3P35244 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPA3P35244 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPA3P35244 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPA3P35244 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPA3P35244 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RPA3P35244 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPA3P35244 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPA3P35244 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPA3P35244 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPA3P35244 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPA3P35244 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPA3P35244 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPA3P35244 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPA3P35244 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPA3P35244 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPA3P35244 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPA3P35244 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPA3P35244 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPA3P35244 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPA3P35244 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RPA3P35244 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RPA3P35244 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RPA3P35244 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RPA3P35244 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RPA3P35244 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RPA3P35244 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RPA3P35244 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RPA3P35244 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RPA3P35244 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPA3P35244 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RPA3P35244 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPA3P35244 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RPA3P35244 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RPA3P35244 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RPA3P35244 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPA3P35244 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPA3P35244 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPA3P35244 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RPA3P35244 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPA3P35244 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPA3P35244 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPA3P35244 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RPA3P35244 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RPA3P35244 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RPA3P35244 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RPA3P35244 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPA3P35244 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RPA3P35244 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPA3P35244 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RPA3P35244 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RPA3P35244 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RPA3P35244 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RPA3P35244 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RPA3P35244 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
RPA3P35244 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPA3P35244 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPA3P35244 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPA3P35244 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RPA3P35244 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPA3P35244 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RPA3P35244 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPA3P35244 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPA3P35244 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPA3P35244 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RPA3P35244 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RPA3P35244 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPA3P35244 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPA3P35244 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RPA3P35244 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPA3P35244 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPA3P35244 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPA3P35244 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPA3P35244 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPA3P35244 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPA3P35244 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RPA3P35244 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RPA3P35244 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms