Protein–RNA interactions for Protein: P23763

VAMP1, Vesicle-associated membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP1P23763 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
VAMP1P23763 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
VAMP1P23763 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
VAMP1P23763 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
VAMP1P23763 LPCAT2-201ENST00000262134 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
VAMP1P23763 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
VAMP1P23763 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
VAMP1P23763 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
VAMP1P23763 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
VAMP1P23763 TMEM168-201ENST00000312814 7470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
VAMP1P23763 TMEM201-201ENST00000340305 3851 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
VAMP1P23763 COL2A1-201ENST00000337299 4257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
VAMP1P23763 CACNA1C-214ENST00000399634 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
VAMP1P23763 CACNA1C-222ENST00000406454 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
VAMP1P23763 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
VAMP1P23763 IL21R-204ENST00000564089 3009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
VAMP1P23763 GFAP-214ENST00000588735 6538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
VAMP1P23763 CACNA1G-209ENST00000502264 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
VAMP1P23763 CACNA1G-221ENST00000510115 6912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
VAMP1P23763 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
VAMP1P23763 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
VAMP1P23763 UGT1A8-201ENST00000373450 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
VAMP1P23763 BRAP-202ENST00000419234 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
VAMP1P23763 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
VAMP1P23763 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
VAMP1P23763 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
VAMP1P23763 TJAP1-204ENST00000372449 2695 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
VAMP1P23763 TJAP1-205ENST00000372452 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
VAMP1P23763 PIM1-201ENST00000373509 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
VAMP1P23763 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
VAMP1P23763 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
VAMP1P23763 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
VAMP1P23763 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
VAMP1P23763 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
VAMP1P23763 CPEB4-208ENST00000520867 2607 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
VAMP1P23763 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
VAMP1P23763 CCDC18-203ENST00000401026 4552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
VAMP1P23763 HNRNPLL-209ENST00000449105 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
VAMP1P23763 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
VAMP1P23763 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
VAMP1P23763 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
VAMP1P23763 HPS1-215ENST00000613394 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
VAMP1P23763 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
VAMP1P23763 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
VAMP1P23763 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
VAMP1P23763 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
VAMP1P23763 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
VAMP1P23763 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
VAMP1P23763 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
VAMP1P23763 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
VAMP1P23763 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
VAMP1P23763 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
VAMP1P23763 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
VAMP1P23763 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
VAMP1P23763 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
VAMP1P23763 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
VAMP1P23763 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
VAMP1P23763 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
VAMP1P23763 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
VAMP1P23763 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
VAMP1P23763 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
VAMP1P23763 NDUFA10-201ENST00000252711 4915 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
VAMP1P23763 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
VAMP1P23763 RIPK4-201ENST00000332512 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
VAMP1P23763 SLC8A3-205ENST00000394330 2622 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
VAMP1P23763 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
VAMP1P23763 ODCP-201ENST00000459650 1639 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
VAMP1P23763 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
VAMP1P23763 SLC12A6-206ENST00000558589 3866 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
VAMP1P23763 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
VAMP1P23763 TNNI1-207ENST00000622580 6142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
VAMP1P23763 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
VAMP1P23763 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
VAMP1P23763 FBLIM1-203ENST00000375771 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
VAMP1P23763 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
VAMP1P23763 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
VAMP1P23763 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
VAMP1P23763 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
VAMP1P23763 FNTB-201ENST00000246166 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
VAMP1P23763 POTEE-201ENST00000356920 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
VAMP1P23763 AP1B1-202ENST00000357586 4176 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
VAMP1P23763 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
VAMP1P23763 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.39
VAMP1P23763 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
VAMP1P23763 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
VAMP1P23763 ANKRD30B-202ENST00000358984 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
VAMP1P23763 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
VAMP1P23763 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
VAMP1P23763 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
VAMP1P23763 DCAF8-201ENST00000326837 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
VAMP1P23763 INCENP-202ENST00000394818 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
VAMP1P23763 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
VAMP1P23763 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
VAMP1P23763 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
VAMP1P23763 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
VAMP1P23763 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
VAMP1P23763 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
VAMP1P23763 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
VAMP1P23763 APBB2-211ENST00000506352 3316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
VAMP1P23763 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms