Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 CAB39L-204ENST00000409130 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRDP23468 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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