Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 AC083801.1-201ENST00000491689 358 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 CISD2-202ENST00000503643 808 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 AF111169.2-201ENST00000553758 721 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 MIR6816-201ENST00000620368 66 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 CDKN2C-202ENST00000371761 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 HCG9-201ENST00000376800 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 TAGLN3-203ENST00000455401 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 AC063952.3-201ENST00000467756 308 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 AC130456.3-201ENST00000561762 633 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 MIR5001-201ENST00000580185 100 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 ANAPC11-221ENST00000584314 559 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 BRSK1-203ENST00000585418 1104 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 AL137793.2-201ENST00000632635 659 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 1479 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 ENPP7P8-202ENST00000527856 1345 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 CRHR1-205ENST00000352855 1146 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 MIR1301-201ENST00000408518 82 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 AL158166.1-201ENST00000433110 371 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 JAZF1-AS1-201ENST00000436758 548 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 AP001062.3-202ENST00000444409 619 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 AL353150.1-201ENST00000456944 583 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 AC093826.1-201ENST00000508655 993 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 GDNF-207ENST00000515058 764 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 AC005845.1-201ENST00000539206 653 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 TMEM202-AS1-201ENST00000562573 723 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 AC006483.2-201ENST00000609813 515 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms