Protein–RNA interactions for Protein: P12004

PCNA, Proliferating cell nuclear antigen, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNAP12004 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PCNAP12004 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PCNAP12004 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PCNAP12004 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PCNAP12004 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PCNAP12004 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PCNAP12004 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PCNAP12004 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PCNAP12004 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PCNAP12004 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PCNAP12004 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PCNAP12004 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PCNAP12004 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PCNAP12004 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PCNAP12004 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PCNAP12004 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PCNAP12004 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PCNAP12004 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
PCNAP12004 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PCNAP12004 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PCNAP12004 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PCNAP12004 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PCNAP12004 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PCNAP12004 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PCNAP12004 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PCNAP12004 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PCNAP12004 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PCNAP12004 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PCNAP12004 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PCNAP12004 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PCNAP12004 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PCNAP12004 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PCNAP12004 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PCNAP12004 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PCNAP12004 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PCNAP12004 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PCNAP12004 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PCNAP12004 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
PCNAP12004 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PCNAP12004 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PCNAP12004 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PCNAP12004 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PCNAP12004 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
PCNAP12004 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PCNAP12004 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PCNAP12004 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PCNAP12004 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PCNAP12004 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PCNAP12004 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PCNAP12004 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PCNAP12004 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PCNAP12004 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PCNAP12004 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PCNAP12004 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PCNAP12004 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PCNAP12004 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PCNAP12004 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PCNAP12004 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PCNAP12004 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PCNAP12004 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PCNAP12004 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PCNAP12004 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PCNAP12004 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PCNAP12004 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PCNAP12004 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PCNAP12004 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PCNAP12004 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PCNAP12004 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PCNAP12004 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PCNAP12004 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCNAP12004 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCNAP12004 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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PCNAP12004 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCNAP12004 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCNAP12004 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCNAP12004 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCNAP12004 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCNAP12004 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCNAP12004 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCNAP12004 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCNAP12004 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCNAP12004 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCNAP12004 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCNAP12004 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCNAP12004 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCNAP12004 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCNAP12004 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCNAP12004 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCNAP12004 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCNAP12004 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCNAP12004 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
PCNAP12004 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCNAP12004 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
PCNAP12004 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCNAP12004 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
PCNAP12004 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCNAP12004 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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