Protein–RNA interactions for Protein: P11441

UBL4A, Ubiquitin-like protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 157 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBL4AP11441 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
UBL4AP11441 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
UBL4AP11441 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
UBL4AP11441 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
UBL4AP11441 SLC38A1-204ENST00000546893 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
UBL4AP11441 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
UBL4AP11441 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
UBL4AP11441 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
UBL4AP11441 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
UBL4AP11441 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
UBL4AP11441 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
UBL4AP11441 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
UBL4AP11441 CYB561-202ENST00000392975 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
UBL4AP11441 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
UBL4AP11441 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
UBL4AP11441 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
UBL4AP11441 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
UBL4AP11441 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
UBL4AP11441 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
UBL4AP11441 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
UBL4AP11441 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
UBL4AP11441 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
UBL4AP11441 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
UBL4AP11441 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
UBL4AP11441 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
UBL4AP11441 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
UBL4AP11441 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
UBL4AP11441 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
UBL4AP11441 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
UBL4AP11441 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
UBL4AP11441 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
UBL4AP11441 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
UBL4AP11441 ZCCHC18-206ENST00000611638 2941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
UBL4AP11441 USH1G-202ENST00000614341 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
UBL4AP11441 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
UBL4AP11441 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
UBL4AP11441 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
UBL4AP11441 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
UBL4AP11441 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
UBL4AP11441 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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UBL4AP11441 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
UBL4AP11441 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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UBL4AP11441 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
UBL4AP11441 ANO7-202ENST00000402430 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
UBL4AP11441 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
UBL4AP11441 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
UBL4AP11441 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
UBL4AP11441 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
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UBL4AP11441 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
UBL4AP11441 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
UBL4AP11441 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
UBL4AP11441 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
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UBL4AP11441 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
UBL4AP11441 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
UBL4AP11441 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
UBL4AP11441 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
UBL4AP11441 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
UBL4AP11441 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
UBL4AP11441 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
UBL4AP11441 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
UBL4AP11441 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
UBL4AP11441 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
UBL4AP11441 DDX43-201ENST00000370336 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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