Protein–RNA interactions for Protein: F8W1W9

NPIPB9, Nuclear pore complex-interacting protein family member B9, humanhuman

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Length 429 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB9F8W1W9 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NPIPB9F8W1W9 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NPIPB9F8W1W9 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NPIPB9F8W1W9 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NPIPB9F8W1W9 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NPIPB9F8W1W9 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NPIPB9F8W1W9 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NPIPB9F8W1W9 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NPIPB9F8W1W9 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NPIPB9F8W1W9 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NPIPB9F8W1W9 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NPIPB9F8W1W9 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NPIPB9F8W1W9 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NPIPB9F8W1W9 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NPIPB9F8W1W9 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NPIPB9F8W1W9 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NPIPB9F8W1W9 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NPIPB9F8W1W9 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NPIPB9F8W1W9 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NPIPB9F8W1W9 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NPIPB9F8W1W9 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NPIPB9F8W1W9 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NPIPB9F8W1W9 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
NPIPB9F8W1W9 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NPIPB9F8W1W9 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NPIPB9F8W1W9 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NPIPB9F8W1W9 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NPIPB9F8W1W9 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
NPIPB9F8W1W9 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NPIPB9F8W1W9 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NPIPB9F8W1W9 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NPIPB9F8W1W9 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NPIPB9F8W1W9 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NPIPB9F8W1W9 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NPIPB9F8W1W9 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
NPIPB9F8W1W9 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NPIPB9F8W1W9 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NPIPB9F8W1W9 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NPIPB9F8W1W9 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NPIPB9F8W1W9 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NPIPB9F8W1W9 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NPIPB9F8W1W9 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NPIPB9F8W1W9 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NPIPB9F8W1W9 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NPIPB9F8W1W9 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NPIPB9F8W1W9 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NPIPB9F8W1W9 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NPIPB9F8W1W9 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NPIPB9F8W1W9 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NPIPB9F8W1W9 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NPIPB9F8W1W9 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NPIPB9F8W1W9 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NPIPB9F8W1W9 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NPIPB9F8W1W9 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NPIPB9F8W1W9 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NPIPB9F8W1W9 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NPIPB9F8W1W9 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NPIPB9F8W1W9 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NPIPB9F8W1W9 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NPIPB9F8W1W9 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NPIPB9F8W1W9 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NPIPB9F8W1W9 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NPIPB9F8W1W9 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NPIPB9F8W1W9 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NPIPB9F8W1W9 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NPIPB9F8W1W9 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NPIPB9F8W1W9 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NPIPB9F8W1W9 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NPIPB9F8W1W9 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NPIPB9F8W1W9 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NPIPB9F8W1W9 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NPIPB9F8W1W9 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NPIPB9F8W1W9 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NPIPB9F8W1W9 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NPIPB9F8W1W9 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NPIPB9F8W1W9 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NPIPB9F8W1W9 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NPIPB9F8W1W9 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NPIPB9F8W1W9 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NPIPB9F8W1W9 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NPIPB9F8W1W9 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NPIPB9F8W1W9 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NPIPB9F8W1W9 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NPIPB9F8W1W9 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NPIPB9F8W1W9 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NPIPB9F8W1W9 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
NPIPB9F8W1W9 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NPIPB9F8W1W9 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
NPIPB9F8W1W9 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NPIPB9F8W1W9 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NPIPB9F8W1W9 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
NPIPB9F8W1W9 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
NPIPB9F8W1W9 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NPIPB9F8W1W9 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NPIPB9F8W1W9 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NPIPB9F8W1W9 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NPIPB9F8W1W9 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NPIPB9F8W1W9 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NPIPB9F8W1W9 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NPIPB9F8W1W9 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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