Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN75

PCDHA12, Protocadherin alpha-12, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHA12Q9UN75 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCDHA12Q9UN75 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCDHA12Q9UN75 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCDHA12Q9UN75 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCDHA12Q9UN75 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCDHA12Q9UN75 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCDHA12Q9UN75 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PCDHA12Q9UN75 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCDHA12Q9UN75 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCDHA12Q9UN75 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCDHA12Q9UN75 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCDHA12Q9UN75 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCDHA12Q9UN75 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCDHA12Q9UN75 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCDHA12Q9UN75 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCDHA12Q9UN75 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCDHA12Q9UN75 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCDHA12Q9UN75 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCDHA12Q9UN75 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCDHA12Q9UN75 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCDHA12Q9UN75 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCDHA12Q9UN75 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCDHA12Q9UN75 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCDHA12Q9UN75 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCDHA12Q9UN75 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCDHA12Q9UN75 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCDHA12Q9UN75 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCDHA12Q9UN75 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCDHA12Q9UN75 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCDHA12Q9UN75 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCDHA12Q9UN75 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCDHA12Q9UN75 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCDHA12Q9UN75 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PCDHA12Q9UN75 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCDHA12Q9UN75 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCDHA12Q9UN75 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCDHA12Q9UN75 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCDHA12Q9UN75 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PCDHA12Q9UN75 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCDHA12Q9UN75 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCDHA12Q9UN75 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCDHA12Q9UN75 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCDHA12Q9UN75 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCDHA12Q9UN75 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCDHA12Q9UN75 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PCDHA12Q9UN75 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCDHA12Q9UN75 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCDHA12Q9UN75 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCDHA12Q9UN75 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCDHA12Q9UN75 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PCDHA12Q9UN75 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCDHA12Q9UN75 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCDHA12Q9UN75 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCDHA12Q9UN75 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCDHA12Q9UN75 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCDHA12Q9UN75 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCDHA12Q9UN75 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCDHA12Q9UN75 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCDHA12Q9UN75 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCDHA12Q9UN75 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCDHA12Q9UN75 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCDHA12Q9UN75 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PCDHA12Q9UN75 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCDHA12Q9UN75 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCDHA12Q9UN75 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCDHA12Q9UN75 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCDHA12Q9UN75 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCDHA12Q9UN75 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCDHA12Q9UN75 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCDHA12Q9UN75 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCDHA12Q9UN75 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PCDHA12Q9UN75 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PCDHA12Q9UN75 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCDHA12Q9UN75 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCDHA12Q9UN75 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCDHA12Q9UN75 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCDHA12Q9UN75 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCDHA12Q9UN75 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCDHA12Q9UN75 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCDHA12Q9UN75 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
PCDHA12Q9UN75 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
PCDHA12Q9UN75 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PCDHA12Q9UN75 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCDHA12Q9UN75 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCDHA12Q9UN75 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCDHA12Q9UN75 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCDHA12Q9UN75 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCDHA12Q9UN75 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCDHA12Q9UN75 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCDHA12Q9UN75 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCDHA12Q9UN75 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PCDHA12Q9UN75 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCDHA12Q9UN75 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCDHA12Q9UN75 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCDHA12Q9UN75 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCDHA12Q9UN75 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCDHA12Q9UN75 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCDHA12Q9UN75 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCDHA12Q9UN75 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCDHA12Q9UN75 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms