Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ99

CDH22, Cadherin-22, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH22Q9UJ99 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH22Q9UJ99 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH22Q9UJ99 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH22Q9UJ99 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH22Q9UJ99 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH22Q9UJ99 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH22Q9UJ99 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH22Q9UJ99 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH22Q9UJ99 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH22Q9UJ99 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH22Q9UJ99 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH22Q9UJ99 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH22Q9UJ99 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH22Q9UJ99 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH22Q9UJ99 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH22Q9UJ99 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH22Q9UJ99 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH22Q9UJ99 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH22Q9UJ99 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH22Q9UJ99 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH22Q9UJ99 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH22Q9UJ99 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH22Q9UJ99 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH22Q9UJ99 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH22Q9UJ99 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH22Q9UJ99 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH22Q9UJ99 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH22Q9UJ99 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH22Q9UJ99 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH22Q9UJ99 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH22Q9UJ99 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH22Q9UJ99 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH22Q9UJ99 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH22Q9UJ99 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH22Q9UJ99 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH22Q9UJ99 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH22Q9UJ99 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH22Q9UJ99 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH22Q9UJ99 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH22Q9UJ99 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH22Q9UJ99 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH22Q9UJ99 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH22Q9UJ99 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH22Q9UJ99 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH22Q9UJ99 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH22Q9UJ99 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH22Q9UJ99 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH22Q9UJ99 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH22Q9UJ99 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH22Q9UJ99 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH22Q9UJ99 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH22Q9UJ99 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH22Q9UJ99 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH22Q9UJ99 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH22Q9UJ99 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH22Q9UJ99 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH22Q9UJ99 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH22Q9UJ99 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH22Q9UJ99 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH22Q9UJ99 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH22Q9UJ99 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH22Q9UJ99 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH22Q9UJ99 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH22Q9UJ99 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH22Q9UJ99 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH22Q9UJ99 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH22Q9UJ99 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH22Q9UJ99 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH22Q9UJ99 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH22Q9UJ99 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH22Q9UJ99 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH22Q9UJ99 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH22Q9UJ99 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH22Q9UJ99 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH22Q9UJ99 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH22Q9UJ99 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH22Q9UJ99 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH22Q9UJ99 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH22Q9UJ99 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH22Q9UJ99 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH22Q9UJ99 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH22Q9UJ99 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH22Q9UJ99 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH22Q9UJ99 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH22Q9UJ99 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH22Q9UJ99 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH22Q9UJ99 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH22Q9UJ99 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH22Q9UJ99 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH22Q9UJ99 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH22Q9UJ99 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH22Q9UJ99 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH22Q9UJ99 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH22Q9UJ99 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH22Q9UJ99 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH22Q9UJ99 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH22Q9UJ99 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH22Q9UJ99 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH22Q9UJ99 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH22Q9UJ99 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms