Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 AL731571.1-201ENST00000617058 5428 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 FUT8-203ENST00000360689 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 CX3CL1-204ENST00000565912 5796 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 THAP2-201ENST00000308086 5719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 CACNA2D1-202ENST00000356860 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 WDFY1-201ENST00000233055 4660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 NOX5-201ENST00000260364 8592 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 THBS2-201ENST00000366787 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 COL20A1-203ENST00000422202 8097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 ABCC6-201ENST00000205557 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 ARHGEF17-201ENST00000263674 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 HECTD1-219ENST00000611816 8980 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 STIM1-220ENST00000616714 4356 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms