Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCS2

CYP4F12, Cytochrome P450 4F12, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F12Q9HCS2 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms