Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms