Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 AC009041.1-201ENST00000565401 544 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.3 ms