Protein–RNA interactions for Protein: Q969W0

SPTSSA, Serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 71 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSAQ969W0 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 INO80-202ENST00000401393 5991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 CDH1-201ENST00000261769 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 OAS3-201ENST00000228928 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms