Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPAP2Q8IXW5 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms