Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWV2

CNTN4, Contactin-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN4Q8IWV2 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CNTN4Q8IWV2 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CNTN4Q8IWV2 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CNTN4Q8IWV2 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CNTN4Q8IWV2 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CNTN4Q8IWV2 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CNTN4Q8IWV2 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CNTN4Q8IWV2 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CNTN4Q8IWV2 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CNTN4Q8IWV2 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CNTN4Q8IWV2 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CNTN4Q8IWV2 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CNTN4Q8IWV2 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CNTN4Q8IWV2 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CNTN4Q8IWV2 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CNTN4Q8IWV2 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CNTN4Q8IWV2 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CNTN4Q8IWV2 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CNTN4Q8IWV2 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CNTN4Q8IWV2 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CNTN4Q8IWV2 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CNTN4Q8IWV2 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CNTN4Q8IWV2 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CNTN4Q8IWV2 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CNTN4Q8IWV2 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CNTN4Q8IWV2 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CNTN4Q8IWV2 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CNTN4Q8IWV2 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CNTN4Q8IWV2 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CNTN4Q8IWV2 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CNTN4Q8IWV2 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CNTN4Q8IWV2 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CNTN4Q8IWV2 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CNTN4Q8IWV2 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CNTN4Q8IWV2 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CNTN4Q8IWV2 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNTN4Q8IWV2 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNTN4Q8IWV2 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNTN4Q8IWV2 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CNTN4Q8IWV2 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNTN4Q8IWV2 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNTN4Q8IWV2 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNTN4Q8IWV2 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNTN4Q8IWV2 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNTN4Q8IWV2 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNTN4Q8IWV2 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNTN4Q8IWV2 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNTN4Q8IWV2 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNTN4Q8IWV2 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNTN4Q8IWV2 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNTN4Q8IWV2 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNTN4Q8IWV2 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNTN4Q8IWV2 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNTN4Q8IWV2 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNTN4Q8IWV2 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNTN4Q8IWV2 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CNTN4Q8IWV2 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNTN4Q8IWV2 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNTN4Q8IWV2 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNTN4Q8IWV2 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNTN4Q8IWV2 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNTN4Q8IWV2 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CNTN4Q8IWV2 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNTN4Q8IWV2 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CNTN4Q8IWV2 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNTN4Q8IWV2 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNTN4Q8IWV2 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNTN4Q8IWV2 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNTN4Q8IWV2 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNTN4Q8IWV2 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNTN4Q8IWV2 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNTN4Q8IWV2 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNTN4Q8IWV2 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNTN4Q8IWV2 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNTN4Q8IWV2 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CNTN4Q8IWV2 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNTN4Q8IWV2 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNTN4Q8IWV2 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNTN4Q8IWV2 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNTN4Q8IWV2 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNTN4Q8IWV2 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNTN4Q8IWV2 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNTN4Q8IWV2 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNTN4Q8IWV2 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNTN4Q8IWV2 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNTN4Q8IWV2 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CNTN4Q8IWV2 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNTN4Q8IWV2 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNTN4Q8IWV2 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNTN4Q8IWV2 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNTN4Q8IWV2 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNTN4Q8IWV2 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNTN4Q8IWV2 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNTN4Q8IWV2 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNTN4Q8IWV2 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNTN4Q8IWV2 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNTN4Q8IWV2 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNTN4Q8IWV2 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNTN4Q8IWV2 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNTN4Q8IWV2 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms