Protein–RNA interactions for Protein: Q587J8

KHDC3L, KHDC3-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KHDC3LQ587J8 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
KHDC3LQ587J8 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
KHDC3LQ587J8 ATP2B2-210ENST00000638646 3465 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
KHDC3LQ587J8 UBE2F-223ENST00000612130 2135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
KHDC3LQ587J8 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
KHDC3LQ587J8 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
KHDC3LQ587J8 POU2F2-202ENST00000389341 6901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
KHDC3LQ587J8 RPUSD4-201ENST00000298317 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
KHDC3LQ587J8 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
KHDC3LQ587J8 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
KHDC3LQ587J8 SLC4A5-201ENST00000346834 6233 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
KHDC3LQ587J8 BMF-201ENST00000354670 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
KHDC3LQ587J8 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
KHDC3LQ587J8 THAP2-201ENST00000308086 5719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
KHDC3LQ587J8 CCDC88C-201ENST00000331194 3104 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
KHDC3LQ587J8 RAB37-202ENST00000392610 2858 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
KHDC3LQ587J8 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
KHDC3LQ587J8 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
KHDC3LQ587J8 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
KHDC3LQ587J8 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
KHDC3LQ587J8 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
KHDC3LQ587J8 RNF43-202ENST00000577625 2198 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
KHDC3LQ587J8 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
KHDC3LQ587J8 VCP-201ENST00000358901 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
KHDC3LQ587J8 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
KHDC3LQ587J8 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
KHDC3LQ587J8 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
KHDC3LQ587J8 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
KHDC3LQ587J8 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
KHDC3LQ587J8 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
KHDC3LQ587J8 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
KHDC3LQ587J8 CYTH1-215ENST00000591455 3286 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
KHDC3LQ587J8 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
KHDC3LQ587J8 GNAL-203ENST00000423027 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
KHDC3LQ587J8 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
KHDC3LQ587J8 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
KHDC3LQ587J8 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
KHDC3LQ587J8 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
KHDC3LQ587J8 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
KHDC3LQ587J8 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
KHDC3LQ587J8 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
KHDC3LQ587J8 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
KHDC3LQ587J8 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
KHDC3LQ587J8 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
KHDC3LQ587J8 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
KHDC3LQ587J8 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
KHDC3LQ587J8 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
KHDC3LQ587J8 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
KHDC3LQ587J8 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
KHDC3LQ587J8 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC11.92□□□□□ -0.5
KHDC3LQ587J8 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
KHDC3LQ587J8 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
KHDC3LQ587J8 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
KHDC3LQ587J8 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
KHDC3LQ587J8 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
KHDC3LQ587J8 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
KHDC3LQ587J8 STX16-NPEPL1-202ENST00000530122 3433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
KHDC3LQ587J8 LDLRAD4-203ENST00000399848 8633 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
KHDC3LQ587J8 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
KHDC3LQ587J8 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
KHDC3LQ587J8 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
KHDC3LQ587J8 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
KHDC3LQ587J8 SCML4-203ENST00000369022 2377 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
KHDC3LQ587J8 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
KHDC3LQ587J8 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
KHDC3LQ587J8 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
KHDC3LQ587J8 UNC5CL-201ENST00000244565 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
KHDC3LQ587J8 COL6A2-203ENST00000397763 3101 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
KHDC3LQ587J8 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
KHDC3LQ587J8 MAMDC4-202ENST00000445819 3895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
KHDC3LQ587J8 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
KHDC3LQ587J8 RAB44-202ENST00000612677 4233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
KHDC3LQ587J8 ABCC6-201ENST00000205557 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
KHDC3LQ587J8 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
KHDC3LQ587J8 ARAP1-201ENST00000334211 4942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
KHDC3LQ587J8 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
KHDC3LQ587J8 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
KHDC3LQ587J8 MEAF6-204ENST00000373075 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
KHDC3LQ587J8 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
KHDC3LQ587J8 TYK2-205ENST00000525621 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
KHDC3LQ587J8 TRPV1-206ENST00000571088 4105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
KHDC3LQ587J8 RIC1-204ENST00000418622 6658 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
KHDC3LQ587J8 NOX5-202ENST00000388866 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
KHDC3LQ587J8 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
KHDC3LQ587J8 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
KHDC3LQ587J8 TRAPPC10-201ENST00000291574 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
KHDC3LQ587J8 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
KHDC3LQ587J8 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
KHDC3LQ587J8 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
KHDC3LQ587J8 KIAA1614-201ENST00000367587 3309 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
KHDC3LQ587J8 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
KHDC3LQ587J8 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
KHDC3LQ587J8 TFR2-205ENST00000462107 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
KHDC3LQ587J8 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
KHDC3LQ587J8 AMOTL2-212ENST00000514516 4521 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
KHDC3LQ587J8 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
KHDC3LQ587J8 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
KHDC3LQ587J8 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
KHDC3LQ587J8 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
KHDC3LQ587J8 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79 ms