Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y2

PKDCC, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCCQ504Y2 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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