Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC16■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC16■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC16■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC16■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC16■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC16■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC16■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms