Protein–RNA interactions for Protein: Q16828

DUSP6, Dual specificity protein phosphatase 6, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP6Q16828 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 SYCN-201ENST00000318438 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 BCAS2P2-201ENST00000425064 674 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 AC116609.2-201ENST00000431542 256 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 TCERG1L-AS1-201ENST00000436942 472 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 AL139008.1-201ENST00000437894 228 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 Z84468.1-201ENST00000626321 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 TP53AIP1-201ENST00000458238 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 AC084752.1-201ENST00000509766 622 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms