Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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