Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GRIK4Q16099 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms