Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 MAP7-205ENST00000544465 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
USF2Q15853 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
USF2Q15853 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
USF2Q15853 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
USF2Q15853 ATG9B-203ENST00000469530 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
USF2Q15853 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
USF2Q15853 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
USF2Q15853 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
USF2Q15853 IFT88-202ENST00000351808 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
USF2Q15853 TFIP11-201ENST00000405938 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
USF2Q15853 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
USF2Q15853 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
USF2Q15853 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
USF2Q15853 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
USF2Q15853 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
USF2Q15853 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
USF2Q15853 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
USF2Q15853 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
USF2Q15853 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
USF2Q15853 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
USF2Q15853 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
USF2Q15853 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC12.19□□□□□ -0.46
USF2Q15853 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
USF2Q15853 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
USF2Q15853 PLEKHB2-202ENST00000403716 4349 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
USF2Q15853 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
USF2Q15853 SEZ6L-203ENST00000360929 6307 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
USF2Q15853 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
USF2Q15853 GFRA1-204ENST00000439649 9216 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
USF2Q15853 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
USF2Q15853 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
USF2Q15853 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
USF2Q15853 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
USF2Q15853 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
USF2Q15853 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
USF2Q15853 ZNF740-201ENST00000416904 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
USF2Q15853 HSD17B4-201ENST00000256216 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
USF2Q15853 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
USF2Q15853 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
USF2Q15853 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
USF2Q15853 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
USF2Q15853 GULP1-207ENST00000409843 2643 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
USF2Q15853 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
USF2Q15853 PFKM-201ENST00000312352 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
USF2Q15853 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
USF2Q15853 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
USF2Q15853 CD22-209ENST00000594250 2107 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
USF2Q15853 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
USF2Q15853 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
USF2Q15853 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
USF2Q15853 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
USF2Q15853 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
USF2Q15853 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
USF2Q15853 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
USF2Q15853 DNMT3B-202ENST00000328111 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
USF2Q15853 CARHSP1-218ENST00000614449 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
USF2Q15853 POLG-202ENST00000442287 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
USF2Q15853 GATAD2A-203ENST00000404158 5776 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
USF2Q15853 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
USF2Q15853 LINC01833-203ENST00000437916 2880 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
USF2Q15853 STRN-201ENST00000263918 8168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
USF2Q15853 DPP10-201ENST00000310323 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
USF2Q15853 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
USF2Q15853 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
USF2Q15853 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
USF2Q15853 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
USF2Q15853 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
USF2Q15853 EPB41L5-205ENST00000452780 6410 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
USF2Q15853 FARP1-201ENST00000319562 10262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
USF2Q15853 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
USF2Q15853 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
USF2Q15853 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
USF2Q15853 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
USF2Q15853 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
USF2Q15853 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
USF2Q15853 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
USF2Q15853 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
USF2Q15853 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
USF2Q15853 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC12.18□□□□□ -0.46
USF2Q15853 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
USF2Q15853 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
USF2Q15853 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
USF2Q15853 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
USF2Q15853 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC12.18□□□□□ -0.46
USF2Q15853 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
USF2Q15853 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
USF2Q15853 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
USF2Q15853 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
USF2Q15853 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
USF2Q15853 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
USF2Q15853 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
USF2Q15853 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC12.18□□□□□ -0.46
USF2Q15853 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC12.18□□□□□ -0.46
USF2Q15853 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
USF2Q15853 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
USF2Q15853 OS9-206ENST00000435406 2346 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
USF2Q15853 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
USF2Q15853 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
USF2Q15853 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
USF2Q15853 AC022497.1-201ENST00000624916 3691 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
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