Protein–RNA interactions for Protein: Q15078

CDK5R1, Cyclin-dependent kinase 5 activator 1, humanhuman

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Length 307 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5R1Q15078 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDK5R1Q15078 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDK5R1Q15078 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDK5R1Q15078 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDK5R1Q15078 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDK5R1Q15078 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDK5R1Q15078 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDK5R1Q15078 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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CDK5R1Q15078 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDK5R1Q15078 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDK5R1Q15078 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDK5R1Q15078 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDK5R1Q15078 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDK5R1Q15078 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDK5R1Q15078 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDK5R1Q15078 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDK5R1Q15078 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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CDK5R1Q15078 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDK5R1Q15078 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDK5R1Q15078 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDK5R1Q15078 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDK5R1Q15078 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
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CDK5R1Q15078 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDK5R1Q15078 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDK5R1Q15078 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDK5R1Q15078 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDK5R1Q15078 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDK5R1Q15078 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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CDK5R1Q15078 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CDK5R1Q15078 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDK5R1Q15078 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDK5R1Q15078 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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CDK5R1Q15078 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDK5R1Q15078 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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CDK5R1Q15078 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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CDK5R1Q15078 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDK5R1Q15078 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDK5R1Q15078 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDK5R1Q15078 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDK5R1Q15078 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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CDK5R1Q15078 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CDK5R1Q15078 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CDK5R1Q15078 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CDK5R1Q15078 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CDK5R1Q15078 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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CDK5R1Q15078 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CDK5R1Q15078 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CDK5R1Q15078 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CDK5R1Q15078 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CDK5R1Q15078 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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CDK5R1Q15078 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CDK5R1Q15078 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CDK5R1Q15078 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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CDK5R1Q15078 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CDK5R1Q15078 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CDK5R1Q15078 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CDK5R1Q15078 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CDK5R1Q15078 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CDK5R1Q15078 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CDK5R1Q15078 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CDK5R1Q15078 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CDK5R1Q15078 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CDK5R1Q15078 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CDK5R1Q15078 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CDK5R1Q15078 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CDK5R1Q15078 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CDK5R1Q15078 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CDK5R1Q15078 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CDK5R1Q15078 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CDK5R1Q15078 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CDK5R1Q15078 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CDK5R1Q15078 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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