Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CHD4Q14839 BCRP4-201ENST00000506079 804 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CHD4Q14839 AC008972.2-201ENST00000606587 494 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CHD4Q14839 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHD4Q14839 SIGLEC20P-201ENST00000595243 1311 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CHD4Q14839 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHD4Q14839 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHD4Q14839 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHD4Q14839 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
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CHD4Q14839 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHD4Q14839 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHD4Q14839 MAD2L1BP-202ENST00000451025 1517 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHD4Q14839 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHD4Q14839 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHD4Q14839 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
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CHD4Q14839 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
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CHD4Q14839 TREM2-202ENST00000373113 1044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
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CHD4Q14839 MT1G-203ENST00000568675 628 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHD4Q14839 PRKACA-208ENST00000589994 1127 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHD4Q14839 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
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CHD4Q14839 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
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CHD4Q14839 GEMIN8P4-201ENST00000380526 729 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CHD4Q14839 AC103702.2-203ENST00000425510 379 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHD4Q14839 AL356000.1-201ENST00000441073 1238 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CHD4Q14839 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHD4Q14839 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHD4Q14839 LINC01485-202ENST00000520324 566 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHD4Q14839 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHD4Q14839 AC120498.5-201ENST00000561757 299 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CHD4Q14839 NECTIN1-203ENST00000341398 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHD4Q14839 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHD4Q14839 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CHD4Q14839 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHD4Q14839 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHD4Q14839 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHD4Q14839 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHD4Q14839 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHD4Q14839 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHD4Q14839 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHD4Q14839 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHD4Q14839 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHD4Q14839 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHD4Q14839 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHD4Q14839 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHD4Q14839 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHD4Q14839 AL008638.4-201ENST00000624792 1315 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CHD4Q14839 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
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