Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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MTMR3Q13615 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
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