Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC14.46□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC14.46□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC14.46□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC14.45□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
C1orf61Q13536 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC14.45□□□□□ -0.1
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