Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
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TOP3AQ13472 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
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TOP3AQ13472 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
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TOP3AQ13472 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TOP3AQ13472 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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TOP3AQ13472 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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TOP3AQ13472 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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TOP3AQ13472 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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TOP3AQ13472 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TOP3AQ13472 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
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TOP3AQ13472 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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TOP3AQ13472 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TOP3AQ13472 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
TOP3AQ13472 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
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TOP3AQ13472 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
TOP3AQ13472 STAB1-201ENST00000321725 7928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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TOP3AQ13472 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
TOP3AQ13472 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
TOP3AQ13472 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
TOP3AQ13472 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
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TOP3AQ13472 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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TOP3AQ13472 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TOP3AQ13472 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TOP3AQ13472 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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TOP3AQ13472 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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TOP3AQ13472 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TOP3AQ13472 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TOP3AQ13472 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TOP3AQ13472 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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TOP3AQ13472 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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TOP3AQ13472 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
TOP3AQ13472 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TOP3AQ13472 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
TOP3AQ13472 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TOP3AQ13472 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TOP3AQ13472 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
TOP3AQ13472 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TOP3AQ13472 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TOP3AQ13472 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TOP3AQ13472 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
TOP3AQ13472 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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