Protein–RNA interactions for Protein: Q01523

DEFA5, Defensin-5, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA5Q01523 TRAK1-201ENST00000327628 5293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
DEFA5Q01523 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
DEFA5Q01523 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
DEFA5Q01523 ZNF335-201ENST00000322927 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
DEFA5Q01523 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
DEFA5Q01523 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
DEFA5Q01523 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
DEFA5Q01523 CYTH1-215ENST00000591455 3286 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
DEFA5Q01523 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
DEFA5Q01523 C1QTNF1-203ENST00000354124 2714 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.7□□□□□ -0.38
DEFA5Q01523 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
DEFA5Q01523 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
DEFA5Q01523 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
DEFA5Q01523 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
DEFA5Q01523 PBRM1-204ENST00000394830 5071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
DEFA5Q01523 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
DEFA5Q01523 ZNF519-206ENST00000589498 2117 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
DEFA5Q01523 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
DEFA5Q01523 TOLLIP-203ENST00000525159 3429 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
DEFA5Q01523 AC104129.1-202ENST00000480694 4481 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
DEFA5Q01523 LCA5-202ENST00000392959 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
DEFA5Q01523 GULP1-207ENST00000409843 2643 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
DEFA5Q01523 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
DEFA5Q01523 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
DEFA5Q01523 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
DEFA5Q01523 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
DEFA5Q01523 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
DEFA5Q01523 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
DEFA5Q01523 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
DEFA5Q01523 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
DEFA5Q01523 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
DEFA5Q01523 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
DEFA5Q01523 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
DEFA5Q01523 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
DEFA5Q01523 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
DEFA5Q01523 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
DEFA5Q01523 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
DEFA5Q01523 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
DEFA5Q01523 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
DEFA5Q01523 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
DEFA5Q01523 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
DEFA5Q01523 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
DEFA5Q01523 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
DEFA5Q01523 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
DEFA5Q01523 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
DEFA5Q01523 PRICKLE1-203ENST00000455697 4277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
DEFA5Q01523 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
DEFA5Q01523 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
DEFA5Q01523 C10orf105-202ENST00000441508 4836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
DEFA5Q01523 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
DEFA5Q01523 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
DEFA5Q01523 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
DEFA5Q01523 KREMEN1-202ENST00000400335 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
DEFA5Q01523 COL6A3-203ENST00000353578 9963 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
DEFA5Q01523 KCNJ9-201ENST00000368088 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
DEFA5Q01523 TTK-201ENST00000230510 3477 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
DEFA5Q01523 COX6B2-210ENST00000593184 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
DEFA5Q01523 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
DEFA5Q01523 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
DEFA5Q01523 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
DEFA5Q01523 RPS6KA2-204ENST00000481261 2297 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
DEFA5Q01523 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
DEFA5Q01523 SCOC-210ENST00000608372 5129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
DEFA5Q01523 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
DEFA5Q01523 TMUB2-201ENST00000319511 2418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
DEFA5Q01523 NR4A2-209ENST00000426264 2642 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
DEFA5Q01523 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
DEFA5Q01523 PEAR1-202ENST00000338302 4970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
DEFA5Q01523 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
DEFA5Q01523 AC106818.1-201ENST00000623223 3242 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
DEFA5Q01523 HNF1A-201ENST00000257555 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
DEFA5Q01523 PCDHA11-202ENST00000616325 3418 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
DEFA5Q01523 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
DEFA5Q01523 KAZN-205ENST00000400798 3643 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
DEFA5Q01523 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
DEFA5Q01523 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
DEFA5Q01523 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
DEFA5Q01523 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
DEFA5Q01523 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
DEFA5Q01523 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
DEFA5Q01523 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
DEFA5Q01523 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
DEFA5Q01523 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
DEFA5Q01523 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
DEFA5Q01523 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
DEFA5Q01523 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
DEFA5Q01523 TBX3-201ENST00000257566 4208 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
DEFA5Q01523 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
DEFA5Q01523 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
DEFA5Q01523 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
DEFA5Q01523 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
DEFA5Q01523 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
DEFA5Q01523 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
DEFA5Q01523 IFT88-202ENST00000351808 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
DEFA5Q01523 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
DEFA5Q01523 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
DEFA5Q01523 ROBO1-201ENST00000436010 7501 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
DEFA5Q01523 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
DEFA5Q01523 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
DEFA5Q01523 FLT4-201ENST00000261937 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms