Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HOXC5Q00444 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HOXC5Q00444 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HOXC5Q00444 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
HOXC5Q00444 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
HOXC5Q00444 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HOXC5Q00444 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HOXC5Q00444 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HOXC5Q00444 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HOXC5Q00444 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HOXC5Q00444 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
HOXC5Q00444 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
HOXC5Q00444 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HOXC5Q00444 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
HOXC5Q00444 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HOXC5Q00444 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HOXC5Q00444 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HOXC5Q00444 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HOXC5Q00444 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HOXC5Q00444 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HOXC5Q00444 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HOXC5Q00444 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HOXC5Q00444 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HOXC5Q00444 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HOXC5Q00444 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HOXC5Q00444 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HOXC5Q00444 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HOXC5Q00444 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HOXC5Q00444 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HOXC5Q00444 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HOXC5Q00444 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HOXC5Q00444 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HOXC5Q00444 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HOXC5Q00444 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
HOXC5Q00444 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HOXC5Q00444 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HOXC5Q00444 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
HOXC5Q00444 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
HOXC5Q00444 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC13.83□□□□□ -0.19
HOXC5Q00444 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
HOXC5Q00444 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
HOXC5Q00444 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
HOXC5Q00444 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
HOXC5Q00444 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HOXC5Q00444 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HOXC5Q00444 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HOXC5Q00444 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HOXC5Q00444 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HOXC5Q00444 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HOXC5Q00444 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HOXC5Q00444 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HOXC5Q00444 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HOXC5Q00444 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HOXC5Q00444 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
HOXC5Q00444 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HOXC5Q00444 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HOXC5Q00444 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HOXC5Q00444 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HOXC5Q00444 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HOXC5Q00444 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HOXC5Q00444 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HOXC5Q00444 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HOXC5Q00444 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HOXC5Q00444 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HOXC5Q00444 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HOXC5Q00444 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HOXC5Q00444 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HOXC5Q00444 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HOXC5Q00444 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HOXC5Q00444 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HOXC5Q00444 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HOXC5Q00444 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HOXC5Q00444 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HOXC5Q00444 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HOXC5Q00444 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HOXC5Q00444 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HOXC5Q00444 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HOXC5Q00444 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HOXC5Q00444 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HOXC5Q00444 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HOXC5Q00444 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HOXC5Q00444 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HOXC5Q00444 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HOXC5Q00444 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HOXC5Q00444 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HOXC5Q00444 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
HOXC5Q00444 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
HOXC5Q00444 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
HOXC5Q00444 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
HOXC5Q00444 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
HOXC5Q00444 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
HOXC5Q00444 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
HOXC5Q00444 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
HOXC5Q00444 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
HOXC5Q00444 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
HOXC5Q00444 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
HOXC5Q00444 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
HOXC5Q00444 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
HOXC5Q00444 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
HOXC5Q00444 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms