Protein–RNA interactions for Protein: P78414

IRX1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX1P78414 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
IRX1P78414 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
IRX1P78414 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
IRX1P78414 TMEM229B-207ENST00000557006 3941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
IRX1P78414 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
IRX1P78414 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
IRX1P78414 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
IRX1P78414 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
IRX1P78414 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
IRX1P78414 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
IRX1P78414 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
IRX1P78414 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
IRX1P78414 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
IRX1P78414 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
IRX1P78414 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
IRX1P78414 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
IRX1P78414 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
IRX1P78414 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
IRX1P78414 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
IRX1P78414 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
IRX1P78414 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
IRX1P78414 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
IRX1P78414 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
IRX1P78414 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
IRX1P78414 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
IRX1P78414 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
IRX1P78414 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
IRX1P78414 AC004241.5-201ENST00000623870 2448 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
IRX1P78414 CCDC57-202ENST00000389641 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
IRX1P78414 CCDC57-206ENST00000392347 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
IRX1P78414 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
IRX1P78414 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
IRX1P78414 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
IRX1P78414 ARGLU1-203ENST00000400198 3390 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
IRX1P78414 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
IRX1P78414 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
IRX1P78414 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
IRX1P78414 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
IRX1P78414 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
IRX1P78414 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IRX1P78414 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IRX1P78414 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IRX1P78414 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IRX1P78414 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IRX1P78414 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
IRX1P78414 RBM15-202ENST00000487146 3316 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IRX1P78414 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IRX1P78414 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IRX1P78414 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
IRX1P78414 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IRX1P78414 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
IRX1P78414 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IRX1P78414 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IRX1P78414 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
IRX1P78414 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
IRX1P78414 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
IRX1P78414 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
IRX1P78414 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IRX1P78414 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
IRX1P78414 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IRX1P78414 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IRX1P78414 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
IRX1P78414 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
IRX1P78414 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IRX1P78414 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
IRX1P78414 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
IRX1P78414 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
IRX1P78414 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
IRX1P78414 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
IRX1P78414 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
IRX1P78414 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
IRX1P78414 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
IRX1P78414 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IRX1P78414 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
IRX1P78414 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IRX1P78414 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
IRX1P78414 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
IRX1P78414 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IRX1P78414 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IRX1P78414 AC021752.1-202ENST00000613161 2398 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
IRX1P78414 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
IRX1P78414 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IRX1P78414 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
IRX1P78414 NFATC1-204ENST00000397790 3453 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IRX1P78414 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IRX1P78414 SLC35A4-203ENST00000612662 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IRX1P78414 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
IRX1P78414 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IRX1P78414 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IRX1P78414 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
IRX1P78414 EMC10-201ENST00000334976 9446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IRX1P78414 PI4KA-201ENST00000255882 6752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IRX1P78414 OS9-218ENST00000551035 2246 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
IRX1P78414 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IRX1P78414 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
IRX1P78414 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
IRX1P78414 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
IRX1P78414 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
IRX1P78414 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
IRX1P78414 CD276-202ENST00000318443 3469 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.2 ms