Protein–RNA interactions for Protein: P48645

NMU, Neuromedin-U, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMUP48645 NPLOC4-202ENST00000374747 5538 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
NMUP48645 TRPM5-203ENST00000533060 3562 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
NMUP48645 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
NMUP48645 KCNMA1-287ENST00000640632 2808 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
NMUP48645 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
NMUP48645 CYB5A-202ENST00000340533 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
NMUP48645 VHL-201ENST00000256474 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
NMUP48645 PAX8-202ENST00000263335 3735 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
NMUP48645 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
NMUP48645 BUB1B-PAK6-201ENST00000441369 2767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
NMUP48645 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NMUP48645 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NMUP48645 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
NMUP48645 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NMUP48645 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NMUP48645 NCDN-201ENST00000356090 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NMUP48645 MSH6-214ENST00000616033 3429 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
NMUP48645 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NMUP48645 MDM1-203ENST00000393543 2718 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NMUP48645 BAIAP2L1-201ENST00000005260 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NMUP48645 DGKZ-204ENST00000454345 4086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NMUP48645 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
NMUP48645 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NMUP48645 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
NMUP48645 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
NMUP48645 AC127496.1-201ENST00000576234 3133 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
NMUP48645 WDR60-202ENST00000407559 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NMUP48645 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NMUP48645 INPP5J-201ENST00000331075 3347 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
NMUP48645 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
NMUP48645 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
NMUP48645 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NMUP48645 RNF43-205ENST00000581868 2610 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
NMUP48645 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
NMUP48645 RBM12-202ENST00000374104 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NMUP48645 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NMUP48645 CCDC144A-204ENST00000360524 5830 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NMUP48645 MYO1C-202ENST00000361007 4734 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
NMUP48645 NECAP2-202ENST00000443980 1929 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
NMUP48645 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NMUP48645 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
NMUP48645 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NMUP48645 PGGHG-204ENST00000409655 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NMUP48645 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
NMUP48645 TSPEAR-AS1-202ENST00000451035 2108 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
NMUP48645 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
NMUP48645 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NMUP48645 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
NMUP48645 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
NMUP48645 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
NMUP48645 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC10.65□□□□□ -0.7
NMUP48645 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
NMUP48645 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
NMUP48645 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NMUP48645 TCTN2-202ENST00000426174 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
NMUP48645 BCORL1-205ENST00000540052 7127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NMUP48645 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
NMUP48645 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
NMUP48645 OPA3-201ENST00000263275 7828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NMUP48645 CSF2RB-203ENST00000406230 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NMUP48645 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
NMUP48645 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
NMUP48645 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
NMUP48645 EWSAT1-201ENST00000415504 2214 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
NMUP48645 FES-201ENST00000328850 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
NMUP48645 BNIP3L-201ENST00000380629 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
NMUP48645 SNCA-204ENST00000394989 3167 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
NMUP48645 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
NMUP48645 NTRK2-208ENST00000395882 7111 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
NMUP48645 RNF43-202ENST00000577625 2198 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
NMUP48645 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
NMUP48645 AC007614.5-201ENST00000623424 8892 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
NMUP48645 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
NMUP48645 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
NMUP48645 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
NMUP48645 HINT3-201ENST00000229633 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NMUP48645 AL845472.1-202ENST00000624675 4080 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
NMUP48645 MBP-208ENST00000397866 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NMUP48645 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NMUP48645 TMEM246-202ENST00000374848 4244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NMUP48645 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC10.64□□□□□ -0.71
NMUP48645 LINC00567-201ENST00000569854 3409 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
NMUP48645 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NMUP48645 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
NMUP48645 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NMUP48645 PNKD-203ENST00000273077 3021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NMUP48645 NCSTN-202ENST00000368063 3031 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NMUP48645 FAM76A-204ENST00000373954 3567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NMUP48645 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NMUP48645 SPATS2-201ENST00000321898 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NMUP48645 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NMUP48645 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
NMUP48645 EPN3-201ENST00000268933 4071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
NMUP48645 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
NMUP48645 PLCXD1-201ENST00000381657 5507 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
NMUP48645 LRRC17-201ENST00000249377 2002 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NMUP48645 KCNV1-202ENST00000524391 6979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NMUP48645 VAT1L-201ENST00000302536 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NMUP48645 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
NMUP48645 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms