Protein–RNA interactions for Protein: P40425

PBX2, Pre-B-cell leukemia transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX2P40425 AC093783.1-201ENST00000612976 329 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PBX2P40425 AL137793.2-201ENST00000632635 659 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PBX2P40425 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PBX2P40425 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PBX2P40425 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PBX2P40425 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PBX2P40425 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PBX2P40425 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PBX2P40425 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PBX2P40425 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PBX2P40425 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PBX2P40425 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PBX2P40425 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PBX2P40425 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PBX2P40425 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PBX2P40425 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PBX2P40425 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PBX2P40425 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PBX2P40425 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PBX2P40425 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PBX2P40425 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PBX2P40425 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PBX2P40425 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PBX2P40425 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PBX2P40425 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PBX2P40425 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PBX2P40425 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PBX2P40425 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PBX2P40425 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PBX2P40425 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PBX2P40425 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PBX2P40425 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PBX2P40425 PSMB4-201ENST00000290541 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PBX2P40425 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PBX2P40425 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PBX2P40425 BX248415.1-201ENST00000367421 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PBX2P40425 IGHV5-51-201ENST00000390626 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PBX2P40425 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PBX2P40425 AL391832.2-203ENST00000423175 554 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PBX2P40425 AL050338.2-202ENST00000431609 956 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PBX2P40425 HMGB3-204ENST00000448905 812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PBX2P40425 RPL9-203ENST00000449470 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PBX2P40425 AC063952.3-201ENST00000467756 308 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PBX2P40425 AC122719.1-201ENST00000507989 559 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PBX2P40425 AC106047.2-201ENST00000511723 743 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PBX2P40425 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PBX2P40425 RAB30-AS1-205ENST00000530270 1116 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PBX2P40425 AC090001.1-201ENST00000553194 467 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PBX2P40425 AC027458.1-201ENST00000563639 613 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PBX2P40425 MBP-238ENST00000580402 915 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PBX2P40425 AC010504.1-201ENST00000591311 585 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PBX2P40425 AC003006.1-202ENST00000594684 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PBX2P40425 RPS5-204ENST00000598098 536 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PBX2P40425 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PBX2P40425 AL118522.1-201ENST00000611368 560 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PBX2P40425 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PBX2P40425 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PBX2P40425 SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PBX2P40425 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PBX2P40425 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PBX2P40425 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PBX2P40425 ING4-207ENST00000446105 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PBX2P40425 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PBX2P40425 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PBX2P40425 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PBX2P40425 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PBX2P40425 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PBX2P40425 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PBX2P40425 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PBX2P40425 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PBX2P40425 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PBX2P40425 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PBX2P40425 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PBX2P40425 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PBX2P40425 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PBX2P40425 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PBX2P40425 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PBX2P40425 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PBX2P40425 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PBX2P40425 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PBX2P40425 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PBX2P40425 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PBX2P40425 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PBX2P40425 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PBX2P40425 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PBX2P40425 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PBX2P40425 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PBX2P40425 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PBX2P40425 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PBX2P40425 XPNPEP2-201ENST00000371105 912 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PBX2P40425 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PBX2P40425 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PBX2P40425 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PBX2P40425 AC023141.7-201ENST00000430646 407 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PBX2P40425 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PBX2P40425 AP001062.3-202ENST00000444409 619 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PBX2P40425 RN7SL582P-201ENST00000491078 279 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PBX2P40425 MGAT4D-203ENST00000511113 1125 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PBX2P40425 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PBX2P40425 ACTR6P1-201ENST00000514311 1104 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms