Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GJB2P29033 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
GJB2P29033 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GJB2P29033 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GJB2P29033 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GJB2P29033 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GJB2P29033 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GJB2P29033 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GJB2P29033 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GJB2P29033 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GJB2P29033 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GJB2P29033 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
GJB2P29033 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GJB2P29033 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GJB2P29033 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GJB2P29033 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GJB2P29033 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GJB2P29033 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GJB2P29033 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GJB2P29033 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GJB2P29033 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GJB2P29033 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GJB2P29033 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GJB2P29033 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GJB2P29033 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GJB2P29033 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GJB2P29033 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GJB2P29033 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GJB2P29033 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GJB2P29033 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GJB2P29033 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GJB2P29033 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GJB2P29033 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GJB2P29033 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GJB2P29033 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GJB2P29033 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GJB2P29033 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GJB2P29033 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GJB2P29033 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GJB2P29033 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GJB2P29033 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GJB2P29033 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GJB2P29033 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GJB2P29033 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GJB2P29033 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
GJB2P29033 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GJB2P29033 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GJB2P29033 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GJB2P29033 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GJB2P29033 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GJB2P29033 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GJB2P29033 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GJB2P29033 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
GJB2P29033 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GJB2P29033 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
GJB2P29033 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GJB2P29033 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GJB2P29033 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GJB2P29033 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GJB2P29033 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GJB2P29033 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GJB2P29033 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GJB2P29033 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GJB2P29033 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GJB2P29033 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GJB2P29033 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GJB2P29033 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GJB2P29033 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GJB2P29033 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GJB2P29033 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GJB2P29033 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GJB2P29033 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GJB2P29033 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GJB2P29033 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GJB2P29033 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GJB2P29033 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GJB2P29033 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GJB2P29033 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GJB2P29033 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GJB2P29033 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GJB2P29033 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GJB2P29033 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GJB2P29033 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GJB2P29033 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GJB2P29033 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GJB2P29033 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GJB2P29033 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GJB2P29033 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GJB2P29033 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GJB2P29033 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GJB2P29033 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GJB2P29033 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GJB2P29033 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GJB2P29033 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GJB2P29033 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GJB2P29033 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GJB2P29033 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GJB2P29033 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GJB2P29033 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GJB2P29033 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms