Protein–RNA interactions for Protein: P17900

GM2A, Ganglioside GM2 activator, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GM2AP17900 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GM2AP17900 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GM2AP17900 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GM2AP17900 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GM2AP17900 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GM2AP17900 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GM2AP17900 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GM2AP17900 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GM2AP17900 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GM2AP17900 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GM2AP17900 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GM2AP17900 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GM2AP17900 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GM2AP17900 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GM2AP17900 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GM2AP17900 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GM2AP17900 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GM2AP17900 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GM2AP17900 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GM2AP17900 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GM2AP17900 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GM2AP17900 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GM2AP17900 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GM2AP17900 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GM2AP17900 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GM2AP17900 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GM2AP17900 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GM2AP17900 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GM2AP17900 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GM2AP17900 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GM2AP17900 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GM2AP17900 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GM2AP17900 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GM2AP17900 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GM2AP17900 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GM2AP17900 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GM2AP17900 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GM2AP17900 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GM2AP17900 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GM2AP17900 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GM2AP17900 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GM2AP17900 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GM2AP17900 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GM2AP17900 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GM2AP17900 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GM2AP17900 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GM2AP17900 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GM2AP17900 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GM2AP17900 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GM2AP17900 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GM2AP17900 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GM2AP17900 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GM2AP17900 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GM2AP17900 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GM2AP17900 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GM2AP17900 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GM2AP17900 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GM2AP17900 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GM2AP17900 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GM2AP17900 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GM2AP17900 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GM2AP17900 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GM2AP17900 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GM2AP17900 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GM2AP17900 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GM2AP17900 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GM2AP17900 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GM2AP17900 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GM2AP17900 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GM2AP17900 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GM2AP17900 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GM2AP17900 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GM2AP17900 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GM2AP17900 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GM2AP17900 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GM2AP17900 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GM2AP17900 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GM2AP17900 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GM2AP17900 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GM2AP17900 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GM2AP17900 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GM2AP17900 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GM2AP17900 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GM2AP17900 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GM2AP17900 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GM2AP17900 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GM2AP17900 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GM2AP17900 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GM2AP17900 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GM2AP17900 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GM2AP17900 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GM2AP17900 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GM2AP17900 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GM2AP17900 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GM2AP17900 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GM2AP17900 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GM2AP17900 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GM2AP17900 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GM2AP17900 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GM2AP17900 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 302.1 ms