Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.4 ms