Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6J7

C11orf49, UPF0705 protein C11orf49, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf49Q9H6J7 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 PTGER4P2-201ENST00000328411 252 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 TMEM95-202ENST00000389982 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 VCX3A-202ENST00000398729 808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 LINC01523-201ENST00000425385 450 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 PTGER4P3-201ENST00000458150 252 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 ALG1L3P-201ENST00000503331 765 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 AL121796.1-201ENST00000505702 466 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 MRPS36-204ENST00000512880 1200 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 IMMP1L-202ENST00000526776 469 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 AC068831.5-201ENST00000557387 328 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 MRPS36-205ENST00000602380 1200 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 AC008972.2-201ENST00000606587 494 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 PROX1-AS1-235ENST00000628896 711 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 SPAAR-203ENST00000636776 1538 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 AL109809.1-201ENST00000418979 1367 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 DNMT3L-204ENST00000628202 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 BBS1-203ENST00000455748 1552 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 CUTA-203ENST00000374500 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 APOA1-203ENST00000375320 940 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 AC112721.1-201ENST00000409162 588 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 AC006329.1-201ENST00000419422 705 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 FTCDNL1-203ENST00000420922 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 AL157832.2-206ENST00000428178 601 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 AC023141.7-201ENST00000430646 407 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 HDAC2-AS2-203ENST00000436876 591 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 MRPL43-211ENST00000477279 903 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 LRRC75A-AS1-213ENST00000484836 821 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 AC090136.2-201ENST00000517809 420 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 AC022858.1-202ENST00000521084 393 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 GSTZ1-210ENST00000554279 795 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 TRMT112P3-201ENST00000580149 358 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 HELLS-212ENST00000630929 400 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 PAIP2-201ENST00000265192 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms