Protein–RNA interactions for Protein: Q96JC1

VPS39, Vam6/Vps39-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 886 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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VPS39Q96JC1 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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VPS39Q96JC1 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
VPS39Q96JC1 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VPS39Q96JC1 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
VPS39Q96JC1 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VPS39Q96JC1 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VPS39Q96JC1 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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VPS39Q96JC1 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VPS39Q96JC1 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
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VPS39Q96JC1 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VPS39Q96JC1 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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VPS39Q96JC1 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
VPS39Q96JC1 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
VPS39Q96JC1 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
VPS39Q96JC1 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
VPS39Q96JC1 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
VPS39Q96JC1 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
VPS39Q96JC1 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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