Protein–RNA interactions for Protein: Q96HS1

PGAM5, Serine/threonine-protein phosphatase PGAM5, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGAM5Q96HS1 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PGAM5Q96HS1 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PGAM5Q96HS1 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PGAM5Q96HS1 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PGAM5Q96HS1 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PGAM5Q96HS1 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PGAM5Q96HS1 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PGAM5Q96HS1 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PGAM5Q96HS1 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PGAM5Q96HS1 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PGAM5Q96HS1 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PGAM5Q96HS1 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PGAM5Q96HS1 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PGAM5Q96HS1 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PGAM5Q96HS1 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PGAM5Q96HS1 COL20A1-203ENST00000422202 8097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PGAM5Q96HS1 CACNA2D1-202ENST00000356860 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PGAM5Q96HS1 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PGAM5Q96HS1 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PGAM5Q96HS1 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PGAM5Q96HS1 ACOX1-201ENST00000293217 7514 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PGAM5Q96HS1 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PGAM5Q96HS1 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PGAM5Q96HS1 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PGAM5Q96HS1 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PGAM5Q96HS1 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PGAM5Q96HS1 CDH1-201ENST00000261769 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PGAM5Q96HS1 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PGAM5Q96HS1 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PGAM5Q96HS1 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PGAM5Q96HS1 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PGAM5Q96HS1 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PGAM5Q96HS1 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PGAM5Q96HS1 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PGAM5Q96HS1 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PGAM5Q96HS1 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PGAM5Q96HS1 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PGAM5Q96HS1 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PGAM5Q96HS1 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PGAM5Q96HS1 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PGAM5Q96HS1 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PGAM5Q96HS1 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PGAM5Q96HS1 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PGAM5Q96HS1 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PGAM5Q96HS1 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PGAM5Q96HS1 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PGAM5Q96HS1 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PGAM5Q96HS1 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PGAM5Q96HS1 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PGAM5Q96HS1 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PGAM5Q96HS1 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PGAM5Q96HS1 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PGAM5Q96HS1 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PGAM5Q96HS1 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PGAM5Q96HS1 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PGAM5Q96HS1 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PGAM5Q96HS1 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PGAM5Q96HS1 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PGAM5Q96HS1 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PGAM5Q96HS1 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PGAM5Q96HS1 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PGAM5Q96HS1 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PGAM5Q96HS1 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PGAM5Q96HS1 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PGAM5Q96HS1 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PGAM5Q96HS1 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PGAM5Q96HS1 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PGAM5Q96HS1 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PGAM5Q96HS1 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PGAM5Q96HS1 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PGAM5Q96HS1 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PGAM5Q96HS1 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PGAM5Q96HS1 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PGAM5Q96HS1 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PGAM5Q96HS1 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PGAM5Q96HS1 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PGAM5Q96HS1 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PGAM5Q96HS1 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PGAM5Q96HS1 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PGAM5Q96HS1 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PGAM5Q96HS1 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PGAM5Q96HS1 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PGAM5Q96HS1 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PGAM5Q96HS1 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PGAM5Q96HS1 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PGAM5Q96HS1 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PGAM5Q96HS1 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PGAM5Q96HS1 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PGAM5Q96HS1 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PGAM5Q96HS1 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PGAM5Q96HS1 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PGAM5Q96HS1 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PGAM5Q96HS1 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PGAM5Q96HS1 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PGAM5Q96HS1 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PGAM5Q96HS1 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PGAM5Q96HS1 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PGAM5Q96HS1 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PGAM5Q96HS1 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PGAM5Q96HS1 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.8 ms