Protein–RNA interactions for Protein: Q92576

PHF3, PHD finger protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,039 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF3Q92576 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms