Protein–RNA interactions for Protein: Q2Q1W2

TRIM71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 868 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM71Q2Q1W2 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM71Q2Q1W2 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM71Q2Q1W2 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM71Q2Q1W2 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM71Q2Q1W2 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM71Q2Q1W2 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM71Q2Q1W2 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM71Q2Q1W2 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM71Q2Q1W2 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM71Q2Q1W2 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM71Q2Q1W2 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM71Q2Q1W2 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM71Q2Q1W2 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRIM71Q2Q1W2 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRIM71Q2Q1W2 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRIM71Q2Q1W2 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRIM71Q2Q1W2 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRIM71Q2Q1W2 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
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TRIM71Q2Q1W2 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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TRIM71Q2Q1W2 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM71Q2Q1W2 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM71Q2Q1W2 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
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TRIM71Q2Q1W2 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM71Q2Q1W2 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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TRIM71Q2Q1W2 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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TRIM71Q2Q1W2 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM71Q2Q1W2 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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TRIM71Q2Q1W2 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM71Q2Q1W2 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM71Q2Q1W2 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM71Q2Q1W2 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM71Q2Q1W2 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM71Q2Q1W2 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM71Q2Q1W2 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM71Q2Q1W2 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM71Q2Q1W2 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM71Q2Q1W2 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM71Q2Q1W2 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM71Q2Q1W2 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM71Q2Q1W2 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM71Q2Q1W2 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM71Q2Q1W2 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM71Q2Q1W2 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM71Q2Q1W2 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM71Q2Q1W2 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM71Q2Q1W2 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM71Q2Q1W2 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM71Q2Q1W2 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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