Protein–RNA interactions for Protein: Q16394

EXT1, Exostosin-1, humanhuman

Predictions only

Length 746 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXT1Q16394 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
EXT1Q16394 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
EXT1Q16394 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
EXT1Q16394 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
EXT1Q16394 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
EXT1Q16394 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
EXT1Q16394 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
EXT1Q16394 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
EXT1Q16394 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
EXT1Q16394 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
EXT1Q16394 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
EXT1Q16394 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
EXT1Q16394 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
EXT1Q16394 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
EXT1Q16394 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
EXT1Q16394 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
EXT1Q16394 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
EXT1Q16394 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
EXT1Q16394 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
EXT1Q16394 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
EXT1Q16394 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
EXT1Q16394 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
EXT1Q16394 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
EXT1Q16394 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
EXT1Q16394 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
EXT1Q16394 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
EXT1Q16394 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
EXT1Q16394 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
EXT1Q16394 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
EXT1Q16394 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
EXT1Q16394 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
EXT1Q16394 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
EXT1Q16394 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
EXT1Q16394 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
EXT1Q16394 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
EXT1Q16394 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
EXT1Q16394 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
EXT1Q16394 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
EXT1Q16394 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
EXT1Q16394 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
EXT1Q16394 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
EXT1Q16394 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
EXT1Q16394 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
EXT1Q16394 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
EXT1Q16394 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
EXT1Q16394 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
EXT1Q16394 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
EXT1Q16394 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
EXT1Q16394 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
EXT1Q16394 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
EXT1Q16394 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
EXT1Q16394 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
EXT1Q16394 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
EXT1Q16394 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
EXT1Q16394 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
EXT1Q16394 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
EXT1Q16394 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
EXT1Q16394 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
EXT1Q16394 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
EXT1Q16394 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
EXT1Q16394 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
EXT1Q16394 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
EXT1Q16394 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
EXT1Q16394 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
EXT1Q16394 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
EXT1Q16394 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
EXT1Q16394 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
EXT1Q16394 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
EXT1Q16394 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
EXT1Q16394 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
EXT1Q16394 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
EXT1Q16394 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
EXT1Q16394 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
EXT1Q16394 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
EXT1Q16394 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
EXT1Q16394 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
EXT1Q16394 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
EXT1Q16394 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
EXT1Q16394 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
EXT1Q16394 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
EXT1Q16394 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
EXT1Q16394 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
EXT1Q16394 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
EXT1Q16394 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
EXT1Q16394 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
EXT1Q16394 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
EXT1Q16394 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
EXT1Q16394 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
EXT1Q16394 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
EXT1Q16394 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
EXT1Q16394 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
EXT1Q16394 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
EXT1Q16394 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
EXT1Q16394 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
EXT1Q16394 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
EXT1Q16394 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
EXT1Q16394 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
EXT1Q16394 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
EXT1Q16394 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
EXT1Q16394 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms