Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
USF2Q15853 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
USF2Q15853 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
USF2Q15853 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
USF2Q15853 ZNF318-201ENST00000361428 8006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
USF2Q15853 DHX37-201ENST00000308736 4550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
USF2Q15853 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
USF2Q15853 SLC6A1-201ENST00000287766 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
USF2Q15853 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
USF2Q15853 PRKCH-201ENST00000332981 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
USF2Q15853 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
USF2Q15853 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
USF2Q15853 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
USF2Q15853 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
USF2Q15853 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
USF2Q15853 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
USF2Q15853 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
USF2Q15853 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
USF2Q15853 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
USF2Q15853 RSBN1L-201ENST00000334955 6422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
USF2Q15853 USP22-206ENST00000537526 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
USF2Q15853 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
USF2Q15853 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
USF2Q15853 RNGTT-202ENST00000369485 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
USF2Q15853 PCF11-201ENST00000298281 7677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
USF2Q15853 CPPED1-202ENST00000381774 6273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
USF2Q15853 STARD13-202ENST00000336934 5917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
USF2Q15853 MCFD2-212ENST00000444761 4169 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
USF2Q15853 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
USF2Q15853 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
USF2Q15853 TMEM201-201ENST00000340305 3851 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
USF2Q15853 AC105345.1-202ENST00000382488 3204 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
USF2Q15853 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
USF2Q15853 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
USF2Q15853 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
USF2Q15853 DOCK4-204ENST00000428084 7997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
USF2Q15853 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
USF2Q15853 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
USF2Q15853 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
USF2Q15853 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
USF2Q15853 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
USF2Q15853 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
USF2Q15853 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
USF2Q15853 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
USF2Q15853 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
USF2Q15853 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
USF2Q15853 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
USF2Q15853 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
USF2Q15853 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
USF2Q15853 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
USF2Q15853 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
USF2Q15853 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
USF2Q15853 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
USF2Q15853 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
USF2Q15853 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
USF2Q15853 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
USF2Q15853 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
USF2Q15853 TDRD9-202ENST00000409874 4782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
USF2Q15853 STRC-213ENST00000541030 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
USF2Q15853 DYSF-206ENST00000409744 6564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
USF2Q15853 DYSF-209ENST00000410041 6594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
USF2Q15853 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
USF2Q15853 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
USF2Q15853 FAM225A-202ENST00000453010 5625 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
USF2Q15853 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
USF2Q15853 SUN2-201ENST00000405018 4022 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
USF2Q15853 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
USF2Q15853 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
USF2Q15853 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
USF2Q15853 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
USF2Q15853 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
USF2Q15853 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
USF2Q15853 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
USF2Q15853 ARHGAP33-204ENST00000378944 4219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
USF2Q15853 PIAS2-201ENST00000324794 4543 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
USF2Q15853 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
USF2Q15853 COX6B2-210ENST00000593184 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
USF2Q15853 ZNF335-201ENST00000322927 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
USF2Q15853 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
USF2Q15853 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
USF2Q15853 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
USF2Q15853 GSE1-203ENST00000405402 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
USF2Q15853 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
USF2Q15853 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
USF2Q15853 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
USF2Q15853 NSD2-205ENST00000382892 7706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
USF2Q15853 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
USF2Q15853 MADD-201ENST00000311027 5990 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
USF2Q15853 PPCDC-201ENST00000342932 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
USF2Q15853 GALNT4-201ENST00000529983 5399 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
USF2Q15853 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
USF2Q15853 NUMA1-205ENST00000393695 7343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
USF2Q15853 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
USF2Q15853 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
USF2Q15853 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
USF2Q15853 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
USF2Q15853 MTMR3-202ENST00000333027 8906 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
USF2Q15853 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
USF2Q15853 TMEM120B-204ENST00000449592 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
USF2Q15853 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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