Protein–RNA interactions for Protein: Q15543

TAF13, Transcription initiation factor TFIID subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF13Q15543 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TAF13Q15543 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TAF13Q15543 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TAF13Q15543 SLC46A1-208ENST00000618626 5363 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TAF13Q15543 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TAF13Q15543 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TAF13Q15543 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TAF13Q15543 DUOX2-201ENST00000389039 6533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TAF13Q15543 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TAF13Q15543 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TAF13Q15543 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 MADD-203ENST00000349238 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 TMEM131L-202ENST00000409663 5017 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 RGS12-204ENST00000382788 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 SH3PXD2A-203ENST00000369774 11468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 TCF4-248ENST00000616053 8140 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 COL6A3-202ENST00000347401 8625 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 COL6A3-209ENST00000472056 8628 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 AP000347.1-201ENST00000417194 5004 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 HECTD1-219ENST00000611816 8980 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 TROVE2-208ENST00000432079 7848 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 ICE1-201ENST00000296564 7927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms