Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
SS18Q15532 FNIP1-205ENST00000615660 6589 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
SS18Q15532 TBKBP1-201ENST00000361722 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SS18Q15532 AMOTL2-212ENST00000514516 4521 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
SS18Q15532 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
SS18Q15532 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SS18Q15532 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
SS18Q15532 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SS18Q15532 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SS18Q15532 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SS18Q15532 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
SS18Q15532 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SS18Q15532 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SS18Q15532 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
SS18Q15532 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SS18Q15532 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
SS18Q15532 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
SS18Q15532 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
SS18Q15532 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
SS18Q15532 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
SS18Q15532 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
SS18Q15532 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
SS18Q15532 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
SS18Q15532 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
SS18Q15532 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
SS18Q15532 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SS18Q15532 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
SS18Q15532 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
SS18Q15532 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
SS18Q15532 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
SS18Q15532 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
SS18Q15532 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
SS18Q15532 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SS18Q15532 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
SS18Q15532 ACTR3-201ENST00000263238 6718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SS18Q15532 MKL1-203ENST00000402042 4343 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SS18Q15532 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SS18Q15532 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SS18Q15532 TRPA1-201ENST00000262209 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SS18Q15532 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
SS18Q15532 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
SS18Q15532 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SS18Q15532 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SS18Q15532 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SS18Q15532 RAPGEF6-207ENST00000507093 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SS18Q15532 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
SS18Q15532 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SS18Q15532 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SS18Q15532 VDR-201ENST00000229022 4773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
SS18Q15532 LRRC8A-203ENST00000372600 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SS18Q15532 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SS18Q15532 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SS18Q15532 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SS18Q15532 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SS18Q15532 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
SS18Q15532 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SS18Q15532 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SS18Q15532 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
SS18Q15532 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SS18Q15532 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
SS18Q15532 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SS18Q15532 THSD7A-205ENST00000617773 10583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
SS18Q15532 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SS18Q15532 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SS18Q15532 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SS18Q15532 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SS18Q15532 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SS18Q15532 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SS18Q15532 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SS18Q15532 ADAMTS9-210ENST00000498707 7624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SS18Q15532 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SS18Q15532 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SS18Q15532 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SS18Q15532 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SS18Q15532 CELSR3-201ENST00000164024 11956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SS18Q15532 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SS18Q15532 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SS18Q15532 TRPM2-203ENST00000397928 6221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SS18Q15532 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SS18Q15532 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SS18Q15532 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SS18Q15532 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SS18Q15532 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SS18Q15532 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SS18Q15532 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SS18Q15532 SETD1B-204ENST00000619791 5901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SS18Q15532 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SS18Q15532 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SS18Q15532 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SS18Q15532 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SS18Q15532 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SS18Q15532 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SS18Q15532 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SS18Q15532 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SS18Q15532 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SS18Q15532 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SS18Q15532 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SS18Q15532 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SS18Q15532 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SS18Q15532 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms