Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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DDX39BQ13838 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
DDX39BQ13838 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
DDX39BQ13838 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
DDX39BQ13838 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
DDX39BQ13838 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
DDX39BQ13838 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
DDX39BQ13838 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
DDX39BQ13838 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
DDX39BQ13838 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
DDX39BQ13838 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
DDX39BQ13838 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
DDX39BQ13838 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
DDX39BQ13838 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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DDX39BQ13838 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
DDX39BQ13838 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
DDX39BQ13838 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
DDX39BQ13838 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
DDX39BQ13838 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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DDX39BQ13838 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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DDX39BQ13838 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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DDX39BQ13838 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DDX39BQ13838 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DDX39BQ13838 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
DDX39BQ13838 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DDX39BQ13838 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DDX39BQ13838 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DDX39BQ13838 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DDX39BQ13838 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DDX39BQ13838 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DDX39BQ13838 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DDX39BQ13838 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DDX39BQ13838 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DDX39BQ13838 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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