Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 CCR7-201ENST00000246657 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 EGR2-202ENST00000411732 2824 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
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TUBA3CQ13748 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
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TUBA3CQ13748 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
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TUBA3CQ13748 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
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TUBA3CQ13748 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
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TUBA3CQ13748 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
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